Protein–RNA interactions for Protein: Q9D411

Tssk4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk4Q9D411 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tssk4Q9D411 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tssk4Q9D411 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms