Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpn3Q9D3W4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpn3Q9D3W4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms