Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snrnp35Q9D384 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snrnp35Q9D384 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrnp35Q9D384 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms