Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rasgef1cQ9D300 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rasgef1cQ9D300 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rasgef1cQ9D300 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasgef1cQ9D300 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasgef1cQ9D300 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasgef1cQ9D300 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasgef1cQ9D300 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rasgef1cQ9D300 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rasgef1cQ9D300 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rasgef1cQ9D300 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rasgef1cQ9D300 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rasgef1cQ9D300 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rasgef1cQ9D300 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rasgef1cQ9D300 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rasgef1cQ9D300 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rasgef1cQ9D300 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rasgef1cQ9D300 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rasgef1cQ9D300 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rasgef1cQ9D300 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rasgef1cQ9D300 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rasgef1cQ9D300 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rasgef1cQ9D300 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rasgef1cQ9D300 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rasgef1cQ9D300 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms