Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trmt44Q9D2Q2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trmt44Q9D2Q2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trmt44Q9D2Q2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt44Q9D2Q2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt44Q9D2Q2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt44Q9D2Q2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt44Q9D2Q2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt44Q9D2Q2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trmt44Q9D2Q2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trmt44Q9D2Q2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trmt44Q9D2Q2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trmt44Q9D2Q2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt44Q9D2Q2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt44Q9D2Q2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt44Q9D2Q2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt44Q9D2Q2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt44Q9D2Q2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt44Q9D2Q2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trmt44Q9D2Q2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trmt44Q9D2Q2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trmt44Q9D2Q2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trmt44Q9D2Q2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms