Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps33aQ9D2N9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms