Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Creb3l4Q9D2A5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Creb3l4Q9D2A5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Creb3l4Q9D2A5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Creb3l4Q9D2A5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Creb3l4Q9D2A5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Creb3l4Q9D2A5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Creb3l4Q9D2A5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Creb3l4Q9D2A5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Creb3l4Q9D2A5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Creb3l4Q9D2A5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Creb3l4Q9D2A5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms