Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F5

Mrnip, MRN complex-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MrnipQ9D1F5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MrnipQ9D1F5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MrnipQ9D1F5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms