Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc167Q9D162 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc167Q9D162 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms