Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc47Q9D024 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc47Q9D024 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms