Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab3bQ9CZT8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab3bQ9CZT8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms