Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Snf8Q9CZ28 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snf8Q9CZ28 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snf8Q9CZ28 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms