Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdhd3Q9CYW4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdhd3Q9CYW4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms