Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXY1

Tmem175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem175Q9CXY1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem175Q9CXY1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem175Q9CXY1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 296.2 ms