Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo1Q9CXH7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sgo1Q9CXH7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sgo1Q9CXH7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms