Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RpainQ9CWY9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RpainQ9CWY9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms