Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Malsu1Q9CWV0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Malsu1Q9CWV0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Malsu1Q9CWV0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms