Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CWU4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CWU4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CWU4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CWU4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CWU4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CWU4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CWU4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CWU4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CWU4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CWU4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CWU4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CWU4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CWU4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CWU4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CWU4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CWU4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CWU4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CWU4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CWU4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CWU4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CWU4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CWU4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9CWU4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CWU4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CWU4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9CWU4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms