Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnnbl1Q9CWL8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnbl1Q9CWL8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnbl1Q9CWL8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnbl1Q9CWL8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms