Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NubplQ9CWD8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NubplQ9CWD8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.8 ms