Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Sycp2Q9CUU3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Sycp2Q9CUU3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Sycp2Q9CUU3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Sycp2Q9CUU3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Sycp2Q9CUU3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
Sycp2Q9CUU3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Sycp2Q9CUU3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Sycp2Q9CUU3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Sycp2Q9CUU3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Sycp2Q9CUU3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Sycp2Q9CUU3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Sycp2Q9CUU3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Sycp2Q9CUU3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Sycp2Q9CUU3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Sycp2Q9CUU3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Sycp2Q9CUU3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Sycp2Q9CUU3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
Sycp2Q9CUU3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Sycp2Q9CUU3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC39.5■■■■□ 3.91
Sycp2Q9CUU3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Sycp2Q9CUU3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Sycp2Q9CUU3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
Sycp2Q9CUU3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
Sycp2Q9CUU3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Sycp2Q9CUU3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
Sycp2Q9CUU3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
Sycp2Q9CUU3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Sycp2Q9CUU3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
Sycp2Q9CUU3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Sycp2Q9CUU3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Sycp2Q9CUU3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
Sycp2Q9CUU3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
Sycp2Q9CUU3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Sycp2Q9CUU3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Sycp2Q9CUU3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Sycp2Q9CUU3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Sycp2Q9CUU3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Sycp2Q9CUU3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Sycp2Q9CUU3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
Sycp2Q9CUU3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Sycp2Q9CUU3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Sycp2Q9CUU3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Sycp2Q9CUU3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Sycp2Q9CUU3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Sycp2Q9CUU3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Sycp2Q9CUU3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
Sycp2Q9CUU3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Sycp2Q9CUU3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Sycp2Q9CUU3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Sycp2Q9CUU3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Sycp2Q9CUU3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Sycp2Q9CUU3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Sycp2Q9CUU3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Sycp2Q9CUU3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Sycp2Q9CUU3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Sycp2Q9CUU3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
Sycp2Q9CUU3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Sycp2Q9CUU3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Sycp2Q9CUU3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Sycp2Q9CUU3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Sycp2Q9CUU3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Sycp2Q9CUU3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Sycp2Q9CUU3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Sycp2Q9CUU3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Sycp2Q9CUU3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
Sycp2Q9CUU3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Sycp2Q9CUU3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Sycp2Q9CUU3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Sycp2Q9CUU3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Sycp2Q9CUU3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
Sycp2Q9CUU3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
Sycp2Q9CUU3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Sycp2Q9CUU3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Sycp2Q9CUU3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
Sycp2Q9CUU3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Sycp2Q9CUU3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Sycp2Q9CUU3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Sycp2Q9CUU3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Sycp2Q9CUU3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Sycp2Q9CUU3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
Sycp2Q9CUU3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Sycp2Q9CUU3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Sycp2Q9CUU3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Sycp2Q9CUU3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Sycp2Q9CUU3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Sycp2Q9CUU3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Sycp2Q9CUU3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Sycp2Q9CUU3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Sycp2Q9CUU3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Sycp2Q9CUU3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Sycp2Q9CUU3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Sycp2Q9CUU3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Sycp2Q9CUU3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms