Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Atp13a2Q9CTG6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp13a2Q9CTG6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp13a2Q9CTG6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms