Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snw1Q9CSN1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Snw1Q9CSN1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snw1Q9CSN1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snw1Q9CSN1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms