Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nrxn1Q9CS84 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nrxn1Q9CS84 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nrxn1Q9CS84 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nrxn1Q9CS84 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Nrxn1Q9CS84 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nrxn1Q9CS84 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nrxn1Q9CS84 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms