Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9CRW3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9CRW3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9CRW3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9CRW3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9CRW3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CRW3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CRW3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CRW3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9CRW3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms