Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR36

Gkn1, Gastrokine-1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn1Q9CR36 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gkn1Q9CR36 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gkn1Q9CR36 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gkn1Q9CR36 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms