Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr3kQ9CQZ7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr3kQ9CQZ7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr3kQ9CQZ7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr3kQ9CQZ7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr3kQ9CQZ7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr3kQ9CQZ7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr3kQ9CQZ7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr3kQ9CQZ7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr3kQ9CQZ7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr3kQ9CQZ7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr3kQ9CQZ7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr3kQ9CQZ7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr3kQ9CQZ7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr3kQ9CQZ7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr3kQ9CQZ7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Polr3kQ9CQZ7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr3kQ9CQZ7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr3kQ9CQZ7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr3kQ9CQZ7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr3kQ9CQZ7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Polr3kQ9CQZ7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Polr3kQ9CQZ7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr3kQ9CQZ7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms