Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PclafQ9CQX4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PclafQ9CQX4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms