Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim8Q9CQQ0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim8Q9CQQ0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms