Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ndufb9Q9CQJ8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms