Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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