Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab5aQ9CQD1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5aQ9CQD1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5aQ9CQD1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms