Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc5Q9CQA1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Trappc5Q9CQA1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc5Q9CQA1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.8 ms