Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
StambpQ9CQ26 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.31■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.31■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.28■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.28■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
StambpQ9CQ26 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
StambpQ9CQ26 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms