Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW0

Cntnap2, Contactin-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap2Q9CPW0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntnap2Q9CPW0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntnap2Q9CPW0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cntnap2Q9CPW0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms