Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
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