Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GpnmbQ99P91 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GpnmbQ99P91 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms