Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep41Q99NF3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep41Q99NF3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cep41Q99NF3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms