Protein–RNA interactions for Protein: Q99N43

Kremen1, Kremen protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kremen1Q99N43 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kremen1Q99N43 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kremen1Q99N43 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kremen1Q99N43 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms