Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brms1Q99N20 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brms1Q99N20 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brms1Q99N20 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms