Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ms4a4dQ99N05 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Ms4a4dQ99N05 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ms4a4dQ99N05 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ms4a4dQ99N05 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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