Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML1

Bbc3, Bcl-2-binding component 3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbc3Q99ML1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bbc3Q99ML1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bbc3Q99ML1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bbc3Q99ML1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bbc3Q99ML1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bbc3Q99ML1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bbc3Q99ML1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bbc3Q99ML1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bbc3Q99ML1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Bbc3Q99ML1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bbc3Q99ML1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms