Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clp1Q99LI9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clp1Q99LI9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clp1Q99LI9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms