Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp16Q99LG0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp16Q99LG0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Usp16Q99LG0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp16Q99LG0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms