Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pagr1aQ99L02 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pagr1aQ99L02 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pagr1aQ99L02 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms