Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnajb11Q99KV1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnajb11Q99KV1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms