Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpifQ99KR7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PpifQ99KR7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PpifQ99KR7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms