Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf19Q99KP6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prpf19Q99KP6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prpf19Q99KP6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms