Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ciao1Q99KN2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ciao1Q99KN2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ciao1Q99KN2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ciao1Q99KN2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms