Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hps4Q99KG7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Hps4Q99KG7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hps4Q99KG7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms